Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc85cE9Q6B2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc85cE9Q6B2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms