Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BC005561E9Q5E2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BC005561E9Q5E2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BC005561E9Q5E2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms