Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms