Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc6D3YZP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc6D3YZP9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc6D3YZP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
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