Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ldlrad1D3YYZ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ldlrad1D3YYZ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ldlrad1D3YYZ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ldlrad1D3YYZ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms