Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms