Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbf1A2A870 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbf1A2A870 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms