Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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