Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms