Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trpc2Q9R244 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms