Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk3Q9QZL0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk3Q9QZL0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms