Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms