Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ybx3Q9JKB3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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