Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Capn12Q9ER56 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms