Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms