Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Med27Q9DB40 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Med27Q9DB40 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms