Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec11cQ9D8V7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sec11cQ9D8V7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sec11cQ9D8V7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sec11cQ9D8V7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms