Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms