Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Cldn22Q9D7U6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn22Q9D7U6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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