Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmigd1Q9D7L8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmigd1Q9D7L8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmigd1Q9D7L8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmigd1Q9D7L8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmigd1Q9D7L8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Tmigd1Q9D7L8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Tmigd1Q9D7L8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms