Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms