Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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