Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms