Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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