Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms