Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r-ps113-201ENSMUST00000121318 1106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm6853-201ENSMUST00000211160 1041 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Sectm1b-207ENSMUST00000170381 1011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ufsp1Q9CZP0 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms