Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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