Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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