Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Msmo1Q9CRA4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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