Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms