Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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