Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim3Q99PE5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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