Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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