Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms