Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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