Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg5Q99J83 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms