Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms