Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b3Q921M3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms