Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms