Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms