Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms