Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CcsapQ8QZT2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms