Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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