Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Depp1Q8K2F3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms