Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CherpQ8CGZ0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CherpQ8CGZ0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms