Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc17Q8CE13 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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