Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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