Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8C708 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q8C708 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q8C708 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms