Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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