Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms